核酸酶整理

分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中，核酸（DNA和RNA）显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作：创造（DNA/RNA pol),读取（各种反式元件）和编辑（各种修饰蛋白）和清除（核酸酶）。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为，同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温，故在此对核酸酶做简要整理。

核酸酶催化机理

待补充

主要活性为核酸酶的酶

此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。

外切酶

名称	生物	功能	备注
Xrn1	E	水解无帽的mRNA的5’	参与真核生物无义介导的mRNA降解（NMD）
FEN I	E	切割因为双链DNA合成而被替换的RNA	因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶
Artemis 蛋白	E	NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端	需要DNA-PKCS将其磷酸化， Artemis是希腊神话中的狩猎女神，并且她支持的人基本上都没善终，这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧
Rnase D	B/E	切下tRNA前体3端最后三个核苷酸（3'-5')
Rnase E	E	细胞质中各种mRNA的降解
Rnase L	E	水解病毒mRNA	被干扰素诱导
dRPase	B	BER中切下5'端的磷酸核糖	BER还有一个3'AP裂合酶，但是它同时催化核糖去环化和内切。
外切核酸酶 IX	B	MMR中从3'端降解错配核酸段
外切核酸酶 VII和RecJ	B	MMR中从5'端降解错配核酸段
EXO1 外切核酸酶1	E	MMR中水解错配核酸端
Rat1	E	RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割

内切酶

名称	生物	功能	备注
Rnase H	B	杂交链RNA切割	H代表hybrid杂交
Rnase H1	E	杂交链RNA切割	H代表hybrid杂交
Rnase M5,M16,M23	B	rRNA前体剪切	M5切5S前体发卡，M16切16S前体发卡，M23切23S前体发卡
Rnase III	B	16S,23SrRNA前体预剪接
Uvr C	B	细菌NER中的内切酶，一次在3'距离4-5nt处切，另一次在5'距离8nt处切	分别用两个结构域切
XPF和XPG	E	真核生物中NER切割，XPG在3'端先切，XPF在5'端后切
5'AP内切酶	B&E	BER中切AP（脱嘌呤位点）的5'端
RuvC	B	同源重组中切割Holliday连接	切两次，切出的产物理论随机。
MutH	B	MMR中识别Gm6ATC，并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端
Rnase P	B/E	tRNA 5'加工	核酶（人mt不是核酶--来自yang sir）
Rnase F	B	tRNA 3'预剪接	下一步接Rnase D
CF I,CF II	E	mRNA 在加尾信号处剪接
Xrn2	E	RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割
RMRP	E	线粒体D环复制时引物加工；5.8S rRNA 5'端加工	核酶
Ago蛋白（包括PIWI）	E	转录后基因表达调控（剪切miRNA、切割mRNA）、转座子沉默

兼具有核酸酶活性的酶

名称	生物	功能	备注
DNA聚合酶	all	不言而喻	5'-3'外切酶活性只有pol I有，Taq没有外切酶活性
逆转录酶	all	不言而喻	RNase H活性 体外常用AMV（最适ph8.3，强活性）和M-MULV（ph7.6，弱活性）的逆转录酶
重组酶	all	同源重组 位点特异性重组 转座	内切酶活性