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AQP                                                                Asn-Pro-Ala

O-linked或N-linked                                        Asn-X-Ser/Thr

PTS1 转运序列                                                 Ser-Lys-Leu

PTS2 转运序列                                                 Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu

ER 转运序列                                                     疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys）

Mt 转运序列                                                    两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys）

Cp 转运序列                                                    富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp

Nuclear 转运序列                                            富含短的Arg，Lys序列

KDEL                                                               字面意思

KKXX                                                               字面意思

两酸                                                                 字面意思，如：Asp-X-Gln

NPXY                                                               字面意思

YXXφ                                                               字面意思

LL                                                                     字面意思

SH2结构域特异结合                                          p-Tyr

SH3结构域特异结合                                          PXXP和RXXK

PTB结构域特异结合                                          NPXY

PDZ结构域特异结合                                         膜蛋白C端aa，通常末端为Val-COOH

WW结构域特异结合                                         XPPXY

（还剩几个结构域无特定结合序列，故不特地列出）

PKA磷酸化序列                                                X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ

膜蛋白内吞序列                                                YXXΦ

P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域           FXFG

Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域                    GLFG

NLS                                                                 PKKKRKV

破坏框                                                             RXXLGXIXN

层粘连蛋白，纤连蛋白等与外基质结合区域       RGD

胶原α链                                                           GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys）