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核酸酶整理
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分子生物学最核心的理论莫过于中心法则。在中心法则中,核酸(DNA和RNA)显然是万众瞩目的中心。细胞对核酸主要有以下这几点操作:创造(DNA/RNA pol),读取(各种反式元件)和编辑(各种修饰蛋白)和清除(核酸酶)。核酸酶在中心法则各大方面都有大作为,<s>同时本人曾因为做到某道细分核酸酶的题而红温,</s>故在此对核酸酶做简要整理。 == 核酸酶催化机理 == 待补充 == 主要活性为核酸酶的酶 == 此处暂不整理限制性内切酶。想看的建议去看看一些公司说明书。 === 外切酶 === {| class="wikitable" !名称 !生物 !功能 !备注 |- |Xrn1 |E |水解无帽的mRNA的5’ | |- |FEN I |E |切割因为双链DNA合成而被替换的RNA |因RNA突出如翼状故取名翼状核酸酶 |- |Artemis 蛋白 |E |NHEJ途径中强行将两个粘端水解成平端 |需要DNA-PK<sub>CS</sub>将其磷酸化, <s>Artemis是希腊神话中的狩猎女神,并且她支持的人基本上都没善终,这大概是因为希腊神话主要是雅典人写的吧</s> |- |Rnase D |B/E |切下tRNA前体3端最后三个核苷酸(3'-5') | |- |Rnase E |E |细胞质中各种mRNA的降解 | |- |Rnase L |E |水解病毒mRNA |被干扰素诱导 |- |dRPase |B |BER中切下5'端的磷酸核糖 |BER还有一个3'AP裂合酶,但是它同时催化核糖去环化和内切。 |- |外切核酸酶 IX |B |MMR中从3'端降解错配核酸段 | |- |外切核酸酶 VII和RecJ |B |MMR中从5'端降解错配核酸段 | |- |EXO1 外切核酸酶1 |E |MMR中水解错配核酸端 | |- |Rat1 |E |RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |} === 内切酶 === {| class="wikitable" |+ !名称 !生物 !功能 !备注 |- |Rnase H |B |杂交链RNA切割 |H代表hybrid杂交 |- |Rnase H1 |E |杂交链RNA切割 |H代表hybrid杂交 |- |Rnase M5,M16,M23 |B |rRNA前体剪切 |M5切5S前体发卡,M16切16S前体发卡,M23切23S前体发卡 |- |Rnase III |B |16S,23SrRNA前体预剪接 | |- |Uvr C |B |细菌NER中的内切酶,一次在3'距离4-5nt处切,另一次在5'距离8nt处切 |分别用两个结构域切 |- |XPF和XPG |E |真核生物中NER切割,XPG在3'端先切,XPF在5'端后切 | |- |5'AP内切酶 |B&E |BER中切AP(脱嘌呤位点)的5'端 | |- |RuvC |B |同源重组中切割Holliday连接 |切两次,切出的产物理论随机。 |- |MutH |B |MMR中识别Gm<sup>6</sup>ATC,并切非甲基化那条链的GATC的G的5'端 | |- |Rnase P |B/E |tRNA 5'加工 |核酶 |- |Rnase F |B |tRNA 3'预剪接 |下一步接Rnase D |- |CF I,CF II |E |mRNA 在加尾信号处剪接 | |- |Xrn2 |E |RNAP I和II类型的转录终止时多余RNA切割 | |- |RMRP |B&E |线粒体D环复制时引物加工;5.8S rRNA 5'端加工 |核酶 |} <ref>杨荣武,2017,分子生物学,第2版,南京大学出版社</ref> == 兼具有核酸酶活性的酶 == 待补充
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