查看“常见序列整理”的源代码

AQP                                                                Asn-Pro-Ala

O-linked或N-linked                                        Asn-X-Ser/Thr

PTS1 转运序列                                                 Ser-Lys-Leu

PTS2 转运序列                                                 Arg/Lys-Leu/Ile-5X-His/Gln-Leu

ER 转运序列                                                     疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys）

Mt 转运序列                                                    两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys）

Cp 转运序列                                                    富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp

Nuclear 转运序列                                            富含短的Arg，Lys序列

KDEL                                                               字面意思

KKXX                                                               字面意思

两酸                                                                 字面意思，如：Asp-X-Gln

NPXY                                                               字面意思

YXXφ                                                               字面意思

LL                                                                     字面意思

SH2结构域特异结合                                          p-Tyr

SH3结构域特异结合                                          PXXP和RXXK

PTB结构域特异结合                                          NPXY

PDZ结构域特异结合                                         膜蛋白C端aa，通常末端为Val-COOH

WW结构域特异结合                                         XPPXY

（还剩几个结构域无特定结合序列，故不特地列出）

PKA磷酸化序列                                                X-Arg-Arg/Lys-X-Ser/Thr-Φ

膜蛋白内吞序列                                                YXXΦ

P62 Nup153核孔复合物蛋白疏水结构域           FXFG

Nup98核孔复合物蛋白疏水结构域                    GLFG

NLS                                                                 PKKKRKV

破坏框                                                             RXXLGXIXN

层粘连蛋白，纤连蛋白等与外基质结合区域       RGD

胶原α链                                                           GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys）


PS：有无好心人帮我对齐一下QAQ，不会编辑
{| class="wikitable"
|+
!
!名称
!序列或特征
!描述
!附加说明
|-
| rowspan="10" |定位信号
|KDEL
|KDEL
|可溶性蛋白内质网驻留信号
|
|-
|HDEL
|HDEL
|同上，在酵母和植物中更常见
|
|-
|KKXX
|KKXX(X为任意氨基酸)
|膜蛋白内质网驻留信号
|
|-
|两酸
|如DXE
|ER→高尔基体转运信号
|
|-
|PTS1
|SKL，存在许多变体
|C端过氧化物酶体定位信号
|受体为PEX5
|-
|PTS2
|(R/K)(L/V/I/Q)(X)<sub>5</sub>(H/Q)(L/A/F)
|N端过氧化物酶体定位信号
|受体为PEX7，共受体为18或20
|-
|mPTS
|
|膜蛋白过氧化物酶体定位信号
|受体为PEX19
|-
|信号肽
|疏水aa核心，多碱性aa（Arg，Lys）
|内质网定位序列
|
|-
|转运肽
|富含Ser，Thr和少量疏水aa，罕见Glu和Asp
|叶绿体定位序列
|
|-
|导肽
|两性螺旋，一侧疏水，一侧碱性（Arg，Lys）
|线粒体定位序列
|
|-
| rowspan="5" |功能序列
|
|GXY（X常为Pro，Y常为Hypro或Hylys）
|胶原的三股螺旋重复序列
|
|-
|
|七肽重复序列，第一位和第四位是疏水氨基酸
|α角蛋白的卷曲螺旋重复序列
|
|-
|
|G-A/S-G-A/S
|β角蛋白的β折叠重复序列
|
|-
|
|N*-X-S/T，X≠P
|N糖基化，发生在N上
|'''O糖基化没有特定的识别位点'''
|-
|
|NPA
|水孔蛋白通道中的关键序列
|
|}